โรงเรียนวัดดอกไม้นี้จัดตั้งโดย พระอธิการหวาน พราหมสโร เจ้าอาวาส พร้อมด้วยประชาชน ร่วมมือกันจัดทำอุปกรณ์การศึกษา เพื่อจัดตั้งโรงเรียน โดยใช้ศาลาการเปรียญเป็นสถานที่เรียน ต่อมา วันที่ ๒ พฤษภาคม พ.ศ.๒๔๙๕ นายอำเภอบางปะหัน ทำพิธีเปิด โดยตั้งชื่อว่าโรงเรียนวัดดอกไม้ ซึ่งมีนายวิจารณ์ เงินบวมวง เป็นครูใหญ่ เปิดสอนในระดับชั้นประถมศึกษาปีที่ ๑-๔ เมื่อวันที่ ๕ ธันวาคม พ.ศ.๒๕๑๓  น.ต.ประสงค์ คันธาจละ พร้อมด้วยชาวคณะช่างอากาศ มอบเงิน ๕,๐๐๐ บาท เป็นเงินในการสร้างอาคารเรียน ในปีงบประมาณ ๒๕๑๕ ทางราชการ จัดงบประมาณ ๑๕๕,๐๐๐ บาท มาสมทบกับทุนเดิม สร้างเป็นอาคาร แบบ ป.๑ ข ขนาด ๔ ห้องเรียน สร้างเสร็จเมื่อวันที่ ๓ พฤษภาคม พ.ศ.๒๕๒๓ องค์การบริหารส่วนจังหวัดจัดงบประมาณ ๒๐๐,๐๐๐ บาท 

สร้างอาคารอเนกประสงค์แบบ จ.อย. ๓๑๒ เสร็จเมื่อวันที่ ๒๘ สิงหาคม พ.ศ.๒๕๒๒