โรงเรียนวัดดอกไม้นี้จัดตั้งโดย พระอธิการหวาน พราหมสโร เจ้าอาวาส พร้อมด้วยประชาชน ร่วมมือกันจัดทำอุปกรณ์การศึกษา เพื่อจัดตั้งโรงเรียน โดยใช้ศาลาการเปรียญเป็นสถานที่เรียน ต่อมา วันที่ ๒ พฤษภาคม พ.ศ.๒๔๙๕ นายอำเภอบางปะหัน ทำพิธีเปิด โดยตั้งชื่อว่าโรงเรียนวัดดอกไม้ ซึ่งมีนายวิจารณ์ เงินบวมวง เป็นครูใหญ่ เปิดสอนในระดับชั้นประถมศึกษาปีที่ ๑-๔ เมื่อวันที่ ๕ ธันวาคม พ.ศ.๒๕๑๓ น.ต.ประสงค์ คันธาจละ พร้อมด้วยชาวคณะช่างอากาศ มอบเงิน ๕,๐๐๐ บาท เป็นเงินในการสร้างอาคารเรียน ในปีงบประมาณ ๒๕๑๕ ทางราชการ จัดงบประมาณ ๑๕๕,๐๐๐ บาท มาสมทบกับทุนเดิม สร้างเป็นอาคาร แบบ ป.๑ ข ขนาด ๔ ห้องเรียน สร้างเสร็จเมื่อวันที่ ๓ พฤษภาคม พ.ศ.๒๕๒๓ องค์การบริหารส่วนจังหวัดจัดงบประมาณ ๒๐๐,๐๐๐ บาท
สร้างอาคารอเนกประสงค์แบบ จ.อย. ๓๑๒ เสร็จเมื่อวันที่ ๒๘ สิงหาคม พ.ศ.๒๕๒๒
รายนามผู้ดำรงตำแหน่งครูใหญ่โรงเรียนวัดดอกไม้
๑. นายวิจารณ์ เงินบวง พ.ศ.๒๔๙๕-๒๕๐๑
๒. นายประเสริฐ รุ้งเพชร พ.ศ.๒๕๐๑-๒๕๐๘
๓. นายบุญเสริม พานิชชอบ พ.ศ.๒๕๐๘-๒๕๒๖
๔. นายสมควร ทัศนะ พ.ศ.๒๕๒๖-๒๕๒๙
๕. นายจรูญ ทองขาว พ.ศ.๒๕๒๙-๒๕๓๒
๖. นายพรพิสิฏฐ์ บำรุงพฤกษ์ พ.ศ.๒๕๓๒-๒๕๓๕
๗. นายประจักษ์ ศรีวัฒนพงศ์ พ.ศ.๒๕๓๕-๒๕๓๖
๘. นางชบา โรจนะเสน พ.ศ.๒๕๓๖-๒๕๓๘
๙. นายพยอม สายัณต์ พ.ศ.๒๕๓๘-๒๕๕๙
๑๐. นางสาวสำอางค์ ต่อสติ พ.ศ.๒๕๕๙-๒๕๖๖
๑๑. ว่าที่ร้อยโทกิตติศักดิ์ บุญศรัทธา พ.ศ.๒๕๖๖-ปัจจุบัน
วิสัยทัศน์โรงเรียนวัดดอกไม้
๑. สร้างโอกาสประสานความร่วมมือกับทุกภาคส่วนในการพัฒนาคุณภาพการศึกษา
๒. หลักสูตรจัดการศึกษาให้มีคุณภาพมีมาตรฐาน เสริมสร้างความตระหนักในคุณค่าของเศรษฐกิจพอเพียง
๓. พัฒนาครูให้มีคุณภาพและประสิทธิภาพ
๔. เพิ่มขีดความสามารถและพัฒนาศักยภาพของผู้เรียนให้ได้มาตรฐานการศึกษา
๕. พัฒนาระบบการบริหารจัดการศึกษาให้ได้มาตรฐาน
๖. พัฒนาสภาพแวดล้อมให้สะอาด ร่มรื่น สวยงาม จัดหาสื่อแหล่งเรียนรู้ให้เอื้อต่อการเรียนรู้
๗. ส่งเสริมการประพฤติปฏิบัติตนของนักเรียน ครู ให้มีคุณธรรม จริยธรรม
๘. สร้างเครือข่ายความร่วมมือกับชุมชนและองค์กรที่เกี่ยวข้อง ระดมทุนพัฒนาการศึกษา
พันธกิจ
๑. สร้างโอกาสประสานความร่วมมือกับทุกภาคส่วนในการพัฒนาคุณภาพการศึกษา
๒. หลักสูตรจัดการศึกษาให้มีคุณภาพมีมาตรฐาน เสริมสร้างความตระหนักในคุณค่าของเศรษฐกิจพอเพียง
๓. พัฒนาครูให้มีคุณภาพและประสิทธิภาพ
๔. เพิ่มขีดความสามารถและพัฒนาศักยภาพของผู้เรียนให้ได้มาตรฐานการศึกษา
๕. พัฒนาระบบการบริหารจัดการศึกษาให้ได้มาตรฐาน
๖. พัฒนาสภาพแวดล้อมให้สะอาด ร่มรื่น สวยงาม จัดหาสื่อแหล่งเรียนรู้ให้เอื้อต่อการเรียนรู้
๗. ส่งเสริมการประพฤติปฏิบัติตนของนักเรียน ครู ให้มีคุณธรรม จริยธรรม
๘. สร้างเครือข่ายความร่วมมือกับชุมชนและองค์กรที่เกี่ยวข้อง ระดมทุนพัฒนาการศึกษา
จุดเน้น
หลักสูตรแกนกลางการศึกษาขันพื้นฐาน มุ่งพัฒนาผู้เรียนให้เป็นคนดี มีปัญญา มีความสุข มีศักยภาพในการศึกษาต่อ และประกอบอาชีพ จึงกำหนดเป็นจุดหมายเพื่อให้เกิดกับผู้เรียน เมื่อจบการศึกษาขั้นพื้นฐาน ดังนี้
๑. มีคุณธรรม จริยธรรม และค่านิยมที่พึงประสงค์ เห็นคุณค่าขงตนเอง มีวินัยและปฏิบัติตนตามหลักธรรมของพรพุทธศาสนา หรือศาสนาที่ตนนับคือ ยึดหลักปรัชญาของเศรษฐกิจพอเพียง
๒. มีความรู้ ความสามารถในการสื่อสาร การคิด การแห้ปัญหา การใช้เทคโนโลยี แลมีทักษะชีวิต
๓. มีสุขภาพกายและสุขภาพจิตที่ดี มีสุขนิสัยและรักการออกสำลังกาย
๔. มีความรักชาติ มีจิตสำนึกในความเป็นพลเมืองไทยและพลโลก ยึดมั่นในวิถีชีวิตและการปกครองตามระบบประชาธิปไตยอันมีพระมหากษัตริย์ทรงเป็นประมุข
๕. มีจิตสำนึกในการอนุรักษ์วัฒนาธรรมแลภูมิปัญญาไทย การอนุรักษ์และพัฒนาสิ่งแวดล้อม มีจิตสาธารณะที่มุ่งทำประประโยชน์และสร้างสิ่งที่ดีงามในสังคม และอยู่ร่วมกันในสังคมอย่างมีความสุข